Introduction. Blastocystis sp. est un protozoaire colonisant le tube digestif de l’Homme et de nombreux animaux et il est à ce jour le parasite le plus fréquemment retrouvé dans les selles humaines. Dans certains pays en développement, sa prévalence dans les populations étudiées peut dépasser 50 %. Sur le plan morphologique, les isolats de Blastocystis sp. trouvés chez différents hôtes sont très similaires. Cependant, ces mêmes isolats présentent entre eux une très grande diversité génétique et pas moins de 17 sous-types (ou génotypes) ont déjà été identifiés à partir de données moléculaires. Des études de génotypage ont été réalisées dans de nombreux pays à travers le monde et en particulier dans certains pays du pourtour méditerranéen comme la France, l’Espagne, l’Italie, la Turquie ou l’Égypte. En revanche, très peu de données de génotypage sont disponibles en Algérie. À cet effet, nous avons réalisé la présente étude dont le but était d’identifier et de génotyper Blastocystis dans des échantillons de selles humaines et animales.
Patients et méthodes. Mille huit cent soixante-neuf (1 869) prélèvements de selles appartenant à un personnel de cuisine dans le cadre du contrôle médical périodique, à des sujets pour la fourniture d’un certificat médical requis pour le traitement d’un dossier de visa et à des patients atteints de troubles gastro-intestinaux ont été examinés. À côté des selles humaines, des échantillons d’animaux, dont 10 volailles, 2 bovins et 2 murins ont été examinés. Toutes les selles ont été soumises à un examen microscopique direct complété par des techniques de concentration et une coloration de Ziehl Neelsen modifiée. La caractérisation moléculaire de 39 isolats humains et 14 d’origine animale a été réalisée par le séquençage et les séquences obtenues comparées à celles disponibles auprès de GenBank. Le séquençage n’a été contributif que pour 30 souches humaines et 9 souches animales.
Résultats. Sur l’ensemble des échantillons humain examinés, 284 étaient positifs (15,19 %) avec une prévalence de 7,38 % pour le Blastocystis. Parmi les 30 souches ayant fait l’objet d’une caractérisation moléculaire, le ST3 était prédominant (15/30, 50 %) suivi de ST1 (10/30, 33,33 %) et en troisième position le ST2 (4/30, 13,33 %). Le ST4 n’a été identifié que chez un seul patient (1/30, 3,33 %). La corrélation entre le statut clinique et le sous-type de Blastocystis identifié a montré que le nombre de ST3 était élevé chez les sujets asymptomatiques (11/15, 73 %) comparativement aux sujets symptomatiques (4/15, 26,66 %), de même pour le sous-type ST1 (7/10, 70 % versus 3/10, 30 %). À l’inverse, le nombre de ST2 était plus élevé chez les sujets présentant des troubles gastro-intestinaux (3/4, 75 %). À côté des souches humaines nous avons génotypé 7 souches aviaires, 2 souches murines et 2 souches bovines. La caractérisation des souches aviaires a révélé 5 ST6 (71,42 %) et 2 ST7 (28, 57 %). Les souches murines et bovines sont identifiées en tant que ST7 et ST6 respectivement.
Molecular characterization of Algerian strains of Blastocystis sp
Introduction. Blastocystis sp. is a protozoan that colonizes the gastrointestinal tract of humans and many animals and is currently the most common parasite found in human stools. In some developing countries, its prevalence in study populations may exceed 50%. Morphologically, isolates of Blastocystis sp. found in different hosts are very similar. However, these same isolates show a very high genetic diversity between them and no less than 17 subtypes (or genotypes) have already been identified from molecular data. Genotyping studies have been carried out in many countries around the world and in particular in some Mediterranean countries such as France, spain, Italy, Turkey and Egypt. However, very little genotyping data is available in Algeria. To this end, we conducted the present study to identify and genotype Blastocystis in human and animal stool samples.
Patients and methods. One thousand eight hundred and sixty-nine (1,869) stool samples from kitchen staff as part of the periodic medical check-up, from subjects for the provision of a medical certificate required for the processing of a visa file and from patients with gastrointestinal disorders were examined. In addition to human faeces, animal samples, including 10 poultry, 2 cattle and 2 murine animals were examined. All stools were subjected to direct microscopic examination supplemented by concentration techniques and modified Ziehl Neelsen staining. Molecular characterization of 39 human and 14 animal isolates was performed by sequencing and the resulting sequences compared with those available from GenBank. Sequencing was only contributory for 30 human and 9 animal strains.
Results. Of all human samples examined 284 were positive (15.19%) with a prevalence of 7.38% for Blastocystis. Of the 30 strains that were molecularly characterized, ST3 was predominant (15/30, 50%) followed by ST1 (10/30, 33.33%) and in third place ST2 (4/30, 13.33%). ST4 was identified in only one patient (1/30, 3.33%). The correlation between clinical status and the subtype of Blastocystis identified showed that the number of ST3 was high in asymptomatic subjects (11/15, 73%) compared to symptomatic subjects (4/15, 26.66%), as well as for the ST1 subtype (7/10, 70% versus 3/10, 30%). Conversely, the number of ST2 was higher in subjects with gastrointestinal disorders (3/4, 75%). In addition to human strains, we genotyped 7 avian, 2 murine and 2 bovine strains. Characterization of the avian strains revealed 5 ST6 (71.42%) and 2 ST7 (28, 57%). The murine and bovine strains are identified as ST7 and ST6 respectively.