Utilisation du matériel génétique extrait des tests de diagnostic rapide du paludisme en PCR lors du Grand Magal de Touba au Sénégal Use of genetic material extracted from rapid malaria diagnostic tests using PCR during the Grand Magal of Touba in Senegal

Résumé

Use of genetic material extracted from rapid malaria diagnostic tests using PCR during the Grand Magal of Touba in Senegal

Introduction. The Grand Magal of Touba (GMT), a religious event, attracts between four and five million pilgrims and poses a significant risk of infectious disease transmission, including malaria. Rapid diagnostic tests (RDTs) are commonly used during the event. This study aimed to validate the use of genetic material extracted from RDTs for retrospective diagnostic testing by PCR.

Methods. Two types of RDTs were collected from eight health facilities in the Mbacké department in 2022 and 2023 during the GMT: Bioline™ Malaria Ag P.f/Pan (Abbott, USA) and ParaHIT® (Arkray, India) which detects Plasmodium falciparum. Real-time PCR (qPCR) was performed after opening the RDTs and extracting DNA/RNA to confirm the visual reading of the antigen tests. The performance of the collected RDTs was calculated relative to the PCR results, which were considered the reference standard.

Results. A total of 2,381 RDTs were collected, 213 of which (8.9%) were positive according to the test readings (135 according to Bioline™ tests, and 78 according to ParaHIT®). According to qPCR, 194 samples (8.1%) were positive for P. falciparum. There were false positives in 39 (2.5%) Bioline™ tests and 57 (7.2%) ParaHIT® tests, as well as false negatives in 68 (4.3%) Bioline™ tests and 9 (1.1%) ParaHIT® tests. The Bioline™ and ParaHIT® tests were 97.3% and 92.5% specific, respectively. Their positive predictive values were 71.1% and 26.9%, respectively, and their negative predictive values were 95.3% and 98.7%, respectively.

Conclusion. Genetic material extracted from RDT cassettes can be used for subsequent PCR diagnosis with increased specificity and sensitivity.

Utilisation du matériel génétique extrait des tests de diagnostic rapide du paludisme en PCR lors du Grand Magal de Touba au Sénégal

Introduction. Le Grand Magal de Touba (GMT) est un événement religieux qui attire entre quatre et cinq millions de pèlerins et présente un risque important de transmission de maladies infectieuses dont le paludisme. L’utilisation des tests de diagnostic rapide (TDR) est habituelle lors de cet événement. L’objectif de cette étude était de valider l’utilisation du matériel génétique extrait des TDR pour la réalisation de tests diagnostiques rétrospectifs par PCR.

Méthode. Deux types de TDR Bioline™ Malaria Ag P.f/Pan (Abbott, USA) et ParaHIT® (Arkray, Inde) utilisés pour la détection de Plasmodium falciparum ont été collectés dans huit structures sanitaires du département de Mbacké en 2022 et 2023 pendant le GMT. Une PCR en temps réel (qPCR) a été réalisée après ouverture des tests TDR et extraction de l'ADN/ARN pour confirmer la lecture visuelle des tests antigéniques. Les performances des TDR collectés ont été calculées par rapport à la PCR considérée comme test de référence.

Résultats. 2 381 TDR ont été collectés dont 213 TDR positifs (8,9 %) d'après la lecture des tests (135 avec les tests Bioline™ et 78 avec les ParaHIT®). En qPCR, 194 échantillons (8,1 %) étaient positifs pour P. falciparum. Des faux positifs ont été notés dans 39 tests Bioline™ (2,5 %) et 57 tests ParaHIT® (7,2 %) et des faux négatifs dans 68 tests Bioline™ (4,3 %) et 9 tests ParaHIT® (1,1 %). Les tests Bioline™ et ParaHIT® avaient des spécificités respectives de 97,3 % et 92,5 %, des valeurs prédictives positives de 71,1 % et 26,9 %, et des valeurs prédictives négatives de 95,3 % et 98,7 % respectivement.

Conclusion. Le matériel génétique extrait des cassettes TDR est utilisable pour réaliser ultérieurement des diagnostics par PCR avec une spécificité et une sensibilité accrue.